RTO廢氣治理裝置在運行過程中，必須落實好相關安全措施，方能開始裝置的運行。

1、嚴格控制RTO裝置燃燒爐入口處理廢氣濃度和流速，保持相對平穩、安全運行，可通過設置緩沖罐、調整風量等預處理設施。

2、RTO裝置使用過程中涉及到的承包商管理，嚴格按照《國家安全監管總局關于加強化工過程安全管理的指導意見》安監總管三〔2013〕88號）第九條“承包商管理”要求進行管理。

3、RTO裝置使用過程中涉及動火作業、受限空間作業等特殊作業，嚴格按照《危險化學品企業特殊作業安全規范》GB 30871-2014）要求進行作業。

4、RTO裝置使用過程中，不間斷做好員工操作、應急等方面安全培訓，提高員工安全操作技能。

5、RTO裝置是一項人機高度結合的設備，雖然其自動化程度較高，但必須安排專人進行維護與管理。如：RTO焚燒爐在發生爆炸前，有機廢氣濃度常會在短時間內迅速升高，此時系統若有人值守，則可提前發出預警并采取必要的措施，避免事故的發生。

6、生產過程中，變更物料，產生新的廢氣的，必須按照變更管理要求開展風險分析。